{"id":122901,"date":"2020-03-04T07:00:09","date_gmt":"2020-03-04T10:00:09","guid":{"rendered":"https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/?p=122901"},"modified":"2020-03-03T18:37:10","modified_gmt":"2020-03-03T21:37:10","slug":"pesquisadores-identificam-genomas-diferentes-nos-2-casos-de-coronavirus-no-brasil","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/pesquisadores-identificam-genomas-diferentes-nos-2-casos-de-coronavirus-no-brasil\/","title":{"rendered":"Pesquisadores identificam genomas diferentes nos 2 casos de coronav\u00edrus no Brasil"},"content":{"rendered":"<p><img loading=\"lazy\" class=\"alignleft size-medium wp-image-122902\" src=\"https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-content\/uploads\/2020\/03\/genoma-300x192.jpg\" alt=\"\" width=\"300\" height=\"192\" srcset=\"https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-content\/uploads\/2020\/03\/genoma-300x192.jpg 300w, https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-content\/uploads\/2020\/03\/genoma.jpg 415w\" sizes=\"(max-width: 300px) 100vw, 300px\" \/>O genoma do coronav\u00edrus (COVID-19) isolado no segundo paciente brasileiro diagnosticado com a doen\u00e7a no s\u00e1bado (29), \u00e9 diferente do encontrado no primeiro caso, confirmado em 26 de fevereiro.<\/p>\n<p>\u201cO primeiro isolado se mostrou geneticamente mais parecido com o v\u00edrus sequenciado na Alemanha. J\u00e1 este segundo genoma assemelha-se mais ao sequenciado na Inglaterra. E ambos s\u00e3o diferentes das sequ\u00eancias chinesas. Tal fato sugere que a epidemia de coronav\u00edrus est\u00e1 ficando madura na Europa, ou seja, j\u00e1 est\u00e1 ocorrendo transmiss\u00e3o interna nos pa\u00edses europeus. Para uma an\u00e1lise mais precisa, por\u00e9m, precisamos dos dados da It\u00e1lia, que ainda n\u00e3o foram sequenciados\u201d, disse \u00e0 Ag\u00eancia FAPESP Ester Sabino, diretora do Instituto de Medicina Tropical (IMT) da Universidade de S\u00e3o Paulo (USP).<\/p>\n<p>O sequenciamento completo do segundo isolado viral foi conclu\u00eddo em apenas 24 horas por pesquisadores do Instituto Adolfo Lutz e da USP. Os dados do estudo, apoiado pela FAPESP, devem ser divulgados em breve.<\/p>\n<p>Ap\u00f3s a publica\u00e7\u00e3o da primeira sequ\u00eancia brasileira do Covid-19 no site Virological.org, no dia 28 de fevereiro, pesquisadores italianos entraram em contato com a equipe da USP para solicitar o compartilhamento dos protocolos usados.<\/p>\n<p>Os isolados virais dos dois pacientes brasileiros diagnosticados com Covid-19 foram sequenciados por um grupo coordenado por Claudio Tavares Sacchi, respons\u00e1vel pelo Laborat\u00f3rio Estrat\u00e9gico do Instituto Adolfo Lutz (LEIAL), e Jaqueline Goes de Jesus, p\u00f3s-doutoranda na Faculdade de Medicina da USP.<\/p>\n<p>O trabalho tem sido conduzido com apoio do Centro Conjunto Brasil-Reino Unido para Descoberta, Diagn\u00f3stico, Gen\u00f4mica e Epidemiologia de Arbov\u00edrus (CADDE) \u2013 uma rede de pesquisadores dedicada a responder e analisar dados de epidemias em tempo real, coordenada por Sabino e Nuno Faria, da Universidade de Oxford, no Reino Unido. O projeto, cujo foco principal \u00e9 o estudo de arboviroses, como dengue e zika, tem apoio de FAPESP, Medical Research Council e Fundo Newton (os dois \u00faltimos do Reino Unido).<\/p>\n<p>\u201cNosso objetivo inicial era treinar a equipe do Adolfo Lutz e implementar a tecnologia necess\u00e1ria para o monitoramento em tempo real da epidemia de dengue em curso no Brasil. Quando foram divulgados os casos de coronav\u00edrus na China, em janeiro, come\u00e7amos a nos preparam para tamb\u00e9m monitorar em tempo real essa nova doen\u00e7a\u201d, contou Sabino.<\/p>\n<p>O grupo faz uso de um equipamento port\u00e1til conhecido como MinION, usado pela primeira vez no pa\u00eds em 2016 para tra\u00e7ar retrospectivamente a dissemina\u00e7\u00e3o e a evolu\u00e7\u00e3o do v\u00edrus Zika nas Am\u00e9ricas).<\/p>\n<p>\u201cEssa agilidade s\u00f3 est\u00e1 sendo poss\u00edvel agora gra\u00e7as ao financiamento cont\u00ednuo que nosso grupo no IMT-USP recebeu desde 2016. Os protocolos para sequenciamento foram desenvolvidos por uma aluna durante est\u00e1gio de pesquisa em Birmingham [Reino Unido]. Conseguimos baixar o custo do teste molecular de US$ 500 [R$ 2,2 mil] para US$ 20 [R$ 89]. \u00c9 um ganho tecnol\u00f3gico enorme para o pa\u00eds\u201d, disse Sabino.<\/p>\n<p>Segundo a pesquisadora, a principal vantagem do monitoramento em tempo real de uma epidemia \u00e9 a possibilidade de identificar de onde exatamente veio o v\u00edrus que chegou ao pa\u00eds. Tal informa\u00e7\u00e3o pode orientar a\u00e7\u00f5es de conten\u00e7\u00e3o e ajudar a reduzir a dissemina\u00e7\u00e3o da doen\u00e7a.<\/p>\n<p>\u201c\u00c9 uma nova ferramenta para vigil\u00e2ncia epidemiol\u00f3gica, que por enquanto s\u00f3 foi testada na \u00c1frica, durante a epidemia de ebola\u201d, disse Sabino. \u201cQueremos divulgar logo esta segunda sequ\u00eancia para ajudar o pessoal da It\u00e1lia a analisar seus dados. Compartilhamos com os italianos o protocolo usado por nossa equipe e os colocamos em contato com o grupo do CADDE na Inglaterra.\u201d<\/p>\n<p>De acordo com Sacchi, enquanto forem confirmados apenas casos espor\u00e1dicos de Covid-19 em S\u00e3o Paulo, todos os genomas ser\u00e3o sequenciados. Caso os testes positivos comecem a se multiplicar em larga escala, o trabalho passar\u00e1 a ser orientado pelo Centro de Vigil\u00e2ncia Epidemiol\u00f3gica (CVE) da Secretaria de Estado da Sa\u00fade, que tamb\u00e9m integra o Projeto CADDE.<\/p>\n<p>\u201cNesse caso o sequenciamento passar\u00e1 a ser feito por amostragem e com base em m\u00e9todos estat\u00edsticos, de modo a garantir que os casos amostrados sejam representativos do total\u201d, explicou o pesquisador do Adolfo Lutz.<\/p>\n<p>Caso seja poss\u00edvel sequenciar um grande n\u00famero de isolados virais, diversos tipos de an\u00e1lise poder\u00e3o ser feitos no futuro, como a evolu\u00e7\u00e3o do v\u00edrus e a identifica\u00e7\u00e3o de cepas de pior evolu\u00e7\u00e3o cl\u00ednica, por exemplo.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>O genoma do coronav\u00edrus (COVID-19) isolado no segundo paciente brasileiro diagnosticado com a doen\u00e7a no<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":122902,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":[],"categories":[],"tags":[],"uagb_featured_image_src":{"full":["https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-content\/uploads\/2020\/03\/genoma.jpg",415,265,false],"thumbnail":["https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-content\/uploads\/2020\/03\/genoma-150x150.jpg",150,150,true],"medium":["https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-content\/uploads\/2020\/03\/genoma-300x192.jpg",300,192,true],"medium_large":["https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-content\/uploads\/2020\/03\/genoma.jpg",415,265,false],"large":["https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-content\/uploads\/2020\/03\/genoma.jpg",415,265,false],"1536x1536":["https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-content\/uploads\/2020\/03\/genoma.jpg",415,265,false],"2048x2048":["https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-content\/uploads\/2020\/03\/genoma.jpg",415,265,false],"cream-magazine-thumbnail-2":["https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-content\/uploads\/2020\/03\/genoma.jpg",415,265,false],"cream-magazine-thumbnail-3":["https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-content\/uploads\/2020\/03\/genoma.jpg",415,265,false],"cream-magazine-thumbnail-4":["https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-content\/uploads\/2020\/03\/genoma.jpg",415,265,false]},"uagb_author_info":{"display_name":"","author_link":"https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/author\/"},"uagb_comment_info":0,"uagb_excerpt":"O genoma do coronav\u00edrus (COVID-19) isolado no segundo paciente brasileiro diagnosticado com a doen\u00e7a no","_links":{"self":[{"href":"https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/122901"}],"collection":[{"href":"https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=122901"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/122901\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-json\/wp\/v2\/media\/122902"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=122901"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=122901"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/espacoecologico.com.br\/arquivo\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=122901"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}